Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMED7Q9Y3B3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMED7Q9Y3B3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms