Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS5Q9UPZ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms