Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM35Q9UPQ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM35Q9UPQ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms