Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNPO2Q9UMS6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNPO2Q9UMS6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms