Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PADI1Q9ULC6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.1 ms