Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms