Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC6Q9UBN7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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