Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFIP11Q9UBB9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms