Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC17A6Q9P2U8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC17A6Q9P2U8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms