Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP1Q9NZI2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms