Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM28Q9NW13 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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