Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATAD3AQ9NVI7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms