Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO28Q9NVF7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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