Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT82Q9NSB4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms