Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms