Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms