Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX9Q9NQ69 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms