Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPJQ9HC77 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms