Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC86Q9H6F5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC86Q9H6F5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms