Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4CQ9C0C4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms