Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms