Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM15Q9C019 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms