Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms