Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR2Q9BYE9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms