Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms