Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SNHG12Q9BXW3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms