Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARD11Q9BXL7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms