Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms