Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB2BQ9BVA1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB2BQ9BVA1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB2BQ9BVA1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB2BQ9BVA1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB2BQ9BVA1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms