Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms