Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MESP1Q9BRJ9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms