Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LPIN3Q9BQK8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms