Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms