Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms