Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGREF1Q99674 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGREF1Q99674 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms