Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms