Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB40CQ96S21 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms