Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF558Q96NG5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms