Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms