Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNBD2Q96M20 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms