Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC35E1Q96K37 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms