Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms