Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EAF1Q96JC9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms