Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TPD52L3Q96J77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms