Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHDQ96IW2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms