Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTERF3Q96E29 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms