Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDCCAG3Q96C92 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDCCAG3Q96C92 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms