Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUNDC1Q96C34 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms