Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPSB1Q96BD6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms