Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms